Kutup bölgesinin derinliklerinde, günün ilk ışıkları buzulların üzerine düşerken, mavi tonlar bir sessizlik içinde birleşiyor. Bu sessizlik, aslında bir tehlikenin habercisi olabilir. Kaptan Pengu, ailesi ve dostlarıyla birlikte yaşadığı bu muazzam doğanın hızla eridiğini gözlemliyor ve bu değişimin etkileri her geçen gün daha belirgin hale geliyor. Doğanın bu kadar hızlı bir şekilde bozulmasına tanık olan Kaptan Pengu, yavru penguenlere doğa sevgisini aşılamak ve çevre bilincini geliştirmek için büyük bir çaba sarf eder. Fakat, bir gün, en yakın dostu kutup ayısı Putuk’un eriyen bir buzulun üzerine düştüğünü ve denize kapıldığını öğrenir. Bu üzücü haber, Kaptan Pengu’yu derinden etkiler ve hemen harekete geçerek Putuk’u aramaya başlar. Ancak, su altındaki karmaşık akıntılar nedeniyle izini kaybetmesi, onun umutsuzluğa kapılmasına neden olur. Tam bu noktada, hayvanlar konseyinden gelen bir mektup, tüm dengeleri değiştirir. Mektubun asıl alıcısı Pelik olmasına rağmen, Pelik’in de kaybolmuş olması nedeniyle mektup yanlışlıkla Kaptan Pengu’ya ulaşır. Mektubu okuyan Kaptan Pengu, hem arkadaşlarını hem de doğayı kurtarmak için büyük bir maceraya atılma kararı alır. Yanına Misket ve Mandalina’yı da alarak, dört cesur dost, hem sevdiklerini hem de buzul bölgesini korumak için tehlikelerle dolu bir yolculuğa çıkarlar.
